Glib · Wiki ·

July 23, 2008

23 July, 5:38pm

"La forma es fondo", dicen los comunicadores, por lo que ejercitar la forma implica pulir un fondo. Pensemos en un blog, en este por ejemplo, en pocas veces hay algo de relevancia que decir, sin embargo a cada post hay un esfuerzo, una idea, una lúdica exposición de hechos, no con un fin presuntoso, o un ánimo de declaración de principios, leyes o verdades eternas. Simplemente por el placer de plasmar, por el placer de retarse uno mismo a hacerlo mejor en el siguiente, por el gusto de jugar con un pensamiento, retorcerlo y ver como se deforma ante tus ojos.

Sin embargo muchos de nosotros tenemos miedo a la crítica y nos congelamos. No queremos expresar nada hasta que ese chispazo único de ingenio sea capaz de pasar todos los jucios y afrentas. Y para la mayoría de las persona ese brillo nucha llega. La autocensura es un paralizadora y toda cabilación se pierde el /dev/null del pensamiento platoniano.

La mayoría de las personas carecemos de chispazos de genialidad y sería un error echarlos de menos o desearlos, porque en realidad nos quedamos con la mejor parte: el juego, poder jugar con nuestras ideas, irlas puliendo, saborearlas, retocarlas, ridiculizarlas o sobrecargarlas. Pero de nuevo, el miedo a la opinión de los demás aniquila este placer y nos reducimos a la frustración.

Hay que darnos la libertad de experimentar y mostrar sin pudor estos experimentos, y hasta tal vez le sean de utilidad a alguien más, pero eso ya sería doble ganancia. Si somos nuestro mejor y lector (crítico y entusiasta a le vez), si guardamos aun lado la paralizante autocensura, si mejoramos la forma continuamente, estaremos creciendo, dando un mayor y profundo fondo.

No, no hay chispazos, sólo un paso a la vez.

Mupen64 Plus


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|_|         http://code.google.com/p/mupen64plus/

Mupen64 Plus es un emulador de Nintendo 64 open source basado en plugins y emula bastantes juegos. para su funcionamiento es necesario contar plugins para vídeo, audio, controles de mando,memoria. al día de hoy es posible usar el emulador a través de 3 interfaces: linea de comando, interfaz Gtk e interfaz KDE4.

la versión actual y estable es la versión 1.4, la lista de compatibilidad de roms la puedes consultar aqui.

la descargas de los binarios y código fuente del emulador para Linux y Windows (32/64) la puedes hacer desde esta liga http://code.google.com/p/mupen64plus/downloads/list

para ponerlo en marcha solo descarga los binarios, descomprime y ejecuta el programa!!!!

quiza te interese primero leer el archivo README para consultar como compilar el programa en caso de que quieras hacerlo.

si tienes problemas para ejecutarlo, asegúrate que cuentes con un tarjeta aceleradora de vídeo por hardware, sitúate en el directorio donde descomprimiste el programa ejecutable y teclea ./mupen64plus ….si como lo esta viendo!!!! el primero carácter es punto , el siguiente caracter es diagonall ,enseguida y sin espacios el nompre del programa, mas sencillo no puede ser!!!!

algunas imágenes:

con una interfaz muy sencilla puedes configurar las opciones de los controles, vídeo y audio.

zelda 64 es un excelente y muy entretenido juego para nintendo 64, de los mejores en su época!!!!

¿Por que tan solito?

Pos nomas, eso es lo que respondo cada que me hacen esa pregunta. La verdad es que todos me ven como un ente extraño en el negocio, todo mundo me pregunta por mi Galleta. Con triste semblante solo atino a decir: “esta de vacaciones”. Chalez, me siento todo asi: Ñeeeeeeeee! Ciao!.

War Games



Next July 24th a special event marks the 25th Anniversary of the release of War Games, some theaters will have the 1983's movie.

I noticed that a second version was filmed, and after the anniversary will be available but the release is direct to DVD, I'm curious to watch how they actualized the technical material, because now you have wireless networks instead the dial access, or better security schemes to make invisible your network and also high-level encrypted, besides the monitor systems which are hard to break. Ok, Hollywood generally doesn't show reality, but some movies are spectacular (or simply stupid) to show the computer world, some times looks like magic ...

I miss the sound of a modem connecting to the internet, or a monocromatic screen with plain text (well, not so much this last because sometimes my X11 crash and you need to fix in the terminal mode).

$ logout

July 22, 2008

La API de mi FinderGrep


en meses pasados estuve desarrollando un programa que básicamente lo que hace es hacer búsquedas y comparaciones a la medida de los resultados que blast arroja, después de los tests que le hice funciono muy bien y el tiempo empleado para procesar y buscar la información que se le pide es relativamente buena comparado con el comando grep..ya me daré tiempo para subir a google code los fuentes.

un resumen de lo que sera la API es:

public void Load(string sourcefile)

public void Load(string sourcefile,string comparedfile)

public void Load(string sourcefile,string comparedfile,string outputfile)

public void FindKey()

public void FindElementFromFileFaster(string id,string comparedfile)

public void StopFindKeyProcess()

estos métodos permiten utilizar los archivos que uses para buscar, hacer comparaciones y obtener un resultado, esta pequeñísima api la usa la interfaz que comente hace tiempo http://frenesssi.wordpress.com/2008/06/17/bio-utilities-sharp-v01/

Xepix con mochila al hombro en Europa!!!!


xepix me platico acerca de su viaje a Europa y aun sigue disfrutando de sus vacaciones en Europa, pero les dejo su experiencia descrita por ella misma…

bueno salí del D.F en un vuelo con escala en Alemania y de ahí espere el cambio hacia Madrid , un pinche taxista me vio cara de turista y me cobro de mas :( ,me hospede en un hostal y al tercer día de haber salido del D.F hice un viaje en tren rumbo acoruña que son de 9 a 10 horas en tren por la noche.
llegue el sábado por la mañana y con solo la dirección que me dio Víctor alias “ceyusa” jejeje, llegue sin problemas a su piso!!! que por cierto no estaba Víctor por que el fue a recogerme a la estación y nunca nos encontramos :), pero ya cuando lo vi, Víctor me dijo…hay me das miedo!!!!! ¿como llegaste? estaba seguro que te perderías para llegar jajajaj y le dije que preguntando se llega a Roma , pues bueno llegue invadí su cuarto con mis maletas, me bañe, salimos a comprar la despensa de la semana, y volvimos a salir para un tour muy rápido por coruña al estilo ceyusa :)

jacob: oye xepix,¿Cual es el estilo de ceyusa? aayy jacob…extra rápido y bien cañero!!!
jacob: ok xepix…pero vamos continua tu relato que todos estamos intrigados..¿que mas sucedió?

bueno pues Víctor y yo nos tomamos unas cañas por que aquí no se que chingados pero a un vaso de chela le llaman cañas!!!!!!, de regreso del tour extra rápido pasamos a un barecillo tomamos 2 cañas cada quien y Víctor me dijo llegando al piso si tienes sueño te puedes dormir mientras me conectare a chatiar…pero como no tenia sueño platicamos y seguimos cheleando un six de chela valenciana que compramos como parte de la despensa se termino y ya eran eso de las 9pm y mira con sol puesto que aquí oscurece a eso de las 11pm, luego salimos por otro six de una chela llamada franciscana para cada uno que tiene mas alcohol que lo normal…pues paso el tiempo seguimos cheleando y me decía ¿no tienes sueño? y yo le respondía que no que quería seguir cheliando total ya solo quedaba una franciscana para cada quien y ni modo tendremos que abrir un vinito blanco para rematar y cataplum!!! que se me sube cañón con la franciscana y ya no sabia ni que decir jejeje ya ahora sip podía irme a dormir..en poco tiempo acostada me dieron ganas de hablar con los mostros!!! y pun!!! al tratar de abrir la puerta que me pego con la misma mi cabecita y también ya andaba flamas el vic.
así que los días que me quede el se hiba a trabajar y me dio unos planos turísticos de valencia para yo hacer mi recorrido como quisiera, y ya en el siguiente fin de semana, el sábado temprano fuimos a santiago regresando por la noche y el domingo temprano a Fisterra. ya después el se fue a la Guadec y yo hacia Madrid y partir en tren hacia valencia que es donde ahora estoy.

jacob: oye xepix y ¿y la imágenes de tu viaje?

si desean ver todas las magnificas fotografías de muchos lugares muy interesantes en España no dejen de visitar el sitio home de xepix, http://www.simbiotica.net/~xepix/

enhorabuena xepix!!!!!!!!

Tratar de estar mejor.

Una disculpa por no haber escrito durante estos días, ni por disciplina hice algo. Las asesorías, y el 360 están empezando a envolver mis momentos del día. Estoy preparando clases por anticipado, paquetes preparados para los diferentes bloques, esto empieza a tomar forma, y me agrada ver como uno de los planes que tenia al [...]

Próxima Reunión GLIB en León Guanajuato


El anfitrión de la próxima reunión glib es nuestro estimado kuyoc y la fecha es el sábado 9 de agosto,la dirección es:

Fray Domingo de Betanzos #131
Fraccionamiento Santo Domingo
León Gto,
Hora: 3:30 pm - 4:00 pm

*como referencia esta a 4 cuadras de educafin.

* Convivencia
* Comida
* Temas:
- DojoToolkit/Aptana en media hora.

si alguien tiene interés en impartir una platica, lo puedes hacer con todo gusto.

Back again to my old theme

islascruz.org is back again to the old orange-blue-and-green theme, wich is some kind of boring but I like it. I have nothing more to say about it. Do you like it?

Batman

Cristina and I went yesterday to the movies, we watch Batman, a really nice movie with no death points. I'm not going to tell you the movie here, just have to say that the movie should be called "The Joker" instead "Batman"

Another review in La-uno.com and another in El jugger.com both in spanish.

Salamanca Sunset..


P1020999.JPG, originally uploaded by markuz.

I took this picture on last Monday (Mon Jul 14 2008)

WTF: Sweeney Todd


How changedis Johnny Depp, originally uploaded by markuz.

Yeah... I know the name is Benjamin instead Benajmin (typo error) but... Johnny....

21 July, 7:00pm

Tengo que confesarles algo horroroso. Estoy cerca de la esquizofrenia. Tengo otro blog y está sindicado en otro planeta. Tengo otra personalidad, otra vida, otro yo.

July 21, 2008

Learning maths with rapidshare


el método para descargas del sitio de red rapidshare para usuarios no premium va que vuela en su complejidad para descargar algún archivo…no nos sorprendamos en ver algo como esto:

July 20, 2008

xmms1.2.10 para Ubuntu y pack de 23 skins vol.1


en una noticia pasada comente sobre xmms1.2.10 en Ubuntu linux, ahora puedes descargar el paquete deb de xmms para ubuntu haciendo clic aqui

los skins clic en esta liga

para descargar los skins clic en esta liga

para aplicar los skins a xmms solo descomprime el archivo compreso y sobre la ventana principal de xmms haz clic derecho y en el menu contextual selecciona “Preferences” y despues selecciona “Skin Browser“, despues solo añade el directorio donde descomprimiste el pack vol1 de skins para xmms y listo.

20 July, 3:48pm

Hoy limpié el baño, ayer la cocina, y sólamente tenía que pensar que Lorena ya deja el piso para hacer la labor gratamente. Me parece increíble esa mujer: sólo vive para ver la tele, comer, sonarse los mocos, cagar, dormir y follar. Asombroso. La mediocridad en su más pura esencia.

Estoy leyendo "La fiesta del chivo" de Vargas Llosa. Me está gustando la historia. Ayer fui al cine y la película también gustó: Tropa de élite. Pero sigo lamentando el forzoso doblaje al que me someten las salas de cine.

Con la llegada de todos los que estaban de vacaciones, comienza ahora sí el trabajo. :S

Emoticons para todos Volumen I


solo guardan la imagen gif animada en tu disco duro de tu computadora y listo.

no me pregunten como se instalan en msn messenger porque no tengo la menor idea de como!!!!

supongo que pueden usarlos en msn messenger, pidgin..etc.

lively Google

Buscando ayuda sobre un problema con xajax me encontré con esta red social lively, esta padre la interacción saliendo de todo lo común pero bueno que puedo yo contar mejor prueben...
jajaja ya cree el cuarto de chat del glib para que no dejen de visitarlo por ahi nos vemos...
Chat de los gliberos
Saludos...

SuricataOS Revision Mangosta - Windows XP Recortado


Básicamente si lo que necesitas es un sistema operativo windows xp que vaya al doble de rápido que un windows xp service pack2 o service pack3 y que ademas puedes instalarlo en la computadora de la abuela SuricataOS es la solución, aparte de linux, sistemas basados en bsd..etc.SuricataOS tiene las siguientes características:

  • En español (100%)
  • SmartBoost: Redes-3D-yodm3D-Imitacion de Aero- librerias beta DirectX10- Nuevo menu portable- Netcrawling opcional
  • Trae menos programas que SOS4, solo los mas utiles.
  • Nuevo theme: MacOS
  • Vista Transformation Pack
  • MacOS Transformation Pack
  • Ahora sepueden ver los detalles de los archivos (antes en la caperta mi musica no se veia)
  • Nuevo Logo
  • Tablet PC
  • Solucionado el booteo desde el CD, ahora es instantaneo
  • Open Office funciona ahora desde el CD.
  • Se pueden explorar unidades con Linux

La velocidad del sistema se logra gracias a varios ajustes, del registro, de los servicios y de los archivos del sistema. El consumo de memoria es normalmente entre un 45 y 60% del consumo de WindowsXP normal, por lo tanto tendras mas memoria libre.

Una imagen de mi escritorio en Ubuntu Linux con virtual box corriendo SuricataOS, realmente es muy rápido, ahora puedes ejecutar aplicaciones desde windows xp que corren muy rápido y no consumen demasiada memoria…se me ocurre que para desarrollar aplicaciones y probar en uno o ambos sistemas operativos a la vez y probar de inmediato la portabilidad de tus aplicaciones.

El consumo de memoria NO esta relacionado con el rendimiento general del sistema, por lo tanto aunque instales miles de programas o actives todos los servicios, y termine consumiendo 250MB de RAM la velocidad del sistema sera aun mayor que la velocidad de WindowsXP consumiendo 100MB, notaras esto al explorar carpetas, iniciar aplicaciones pesadas (Photoshop, 3DsMAX) o en juegos a pantalla completa.

Un ejemplo practico:
Windows Normal: Tu PC funciona a 300KM/h, le pones el norton antivirus y el office, luego de esto funciona a 200KM/h.
SuricataOS: La misma PC funciona a 350KM/h, le pones el Norton y el Office y luego funciona a 250KM/h

SuricataOS puede correr perfectamente bien en un procesador Pentium 1, asi como en los nuevos procesadores Core Duo.

Si eres usuario de windows 98 ya puedes quemar,romper los discos de windows 98 porque SuricataOS va mas rapido que windows 98.

La diferencia de velocidad inicial se mantiene atraves del tiempo.

Descarga desde rapidshare.
http://rapidshare.com/files/39678780/SOS_RM.part1.rar
http://rapidshare.com/files/39699580/SOS_RM.part2.rar
http://rapidshare.com/files/39733387/SOS_RM.part3.rar
http://rapidshare.com/files/39950852/SOS_RM.part4.rar
http://rapidshare.com/files/40078299/SOS_RM.part5.rar
http://rapidshare.com/files/39759733/SOS_RM.part6.rar

Después de que descargues los archivos rar, descomprime y vas a obtener una imagen iso que puedes quemar a un cd o dvd y para esto puedes usar programas como Alcohol120%, AShampoo Burner Studio, Nero en Windows o k3b o la linea de comandos en GNU/Linux.

July 19, 2008

Impostor


Bioinformatic:
Which is the best blast E-value?

July 18, 2008

Ocultar iconos de particiones en tu escritorio Gnome


para ocultar los iconos de las particiones o volumenes de tu escritorio solo sigue los siguientes pasos:

  1. ejecuta gconf-editor desde la terminal/consola o teclea ALT-F2 y escribe gconf-editor
  2. en el panel izquierdo del editor navega hacia apps - - >nautilus - - >desktop
  3. haz clic en las opciones volumes_visible

cierra el editor y listo no veras mas los iconos en tu escritorio.

esto lo vi en: http://ministeriosjm.com/area51/~jacob/blog/

Asesorías… tareas?

De dar asesorías, termine haciendo les la tarea… descubre una necesidad y satisfacela, comentan las personas con grandes y continuos ceros en sus cuentas de bancos.. bueno.. por el momento tengo que terminar de hacer la tarea… de alguien mas.. al menos ya las cobro bien…

When visuals gone wrong ...

If you are in biosciences related work many times you have seen a fabulous but meaning-less image in the sci papers, typical error to represent data with wrong visuals perceptions, M. E. J. Newman named "Ridiculograms" (you can see the related video in Youtube).

A ridiculogram can be defined as:
  • Visual stunning
  • Scientifically worthless
  • Published in Nature or Science

After a group discussion and a no so good seminar about text mining for disease terms, some agree that the last point can not be required, I want to extend this concept to other parts in bioinformatics.

Many people are working in the user interaction part, novel technologies have large and heavy output and require some tools to show the results, but many of this tools are redundant (yes, many people want a desktop/web/network interfaces or some programs for Linux/Windows/Mac or versions in Java/C#/Python/Perl) and while the developers think "in the user experience", they forget the concept of the tool: to show an interpretable way for the data.

Besides, this infinite dataset are non-human analyzable, who can read thousand of alignments just to say if well annotate a genomic bank? or just give the information to an army of slaves/students to perform automatic process. Maybe the way in some bioinformatic tools follow endless paths.

I prefer to code for real tools which can give a clue in the biological universe even if this looks ugly.

July 17, 2008

17 July, 5:30pm

Las últimas dos semanas fueron intensas: en la primera fuimos a Madrid a la Guadec-ES, donde presenté, a final de cuentas, el ytviewer de Sandino, ya que mi versión en C no la pude terminar. De Madrid y Fuenlabrada conocí poco salvo las estaciones del Renfe junto con la tristemente célebre Atocha. La posterior volamos a Estambul.

¿Qué puedo contar de Estambul? Es toda una experiencia. Cuando uno se percata de lo que fue el imperio Otomano y se respiran sus ruinas, uno despierta a lo localista que forjamos nuestra visión de la realidad. El mundo, a pesar de lo intercomunicado, es muy grande y complejo, pero a la vez es común. Me sorprendió encontrar muchas similitudes entre México, D.F. y Estambul, la comida, el caos, la gente, la belleza, la decadencia; y a la vez encontrar muchas diferencias. Fue como descubrir que realmente los humanos no tenemos grandes diferencias, pero las que tenemos nos definen y nos dan un valor de unicidad increíble y hermoso.

Turquía es un país que se debate entre la modernidad y las costumbres, entre oriente y occidente, entre el mundo musulmán y el cristianismo liviano. Divide a Europa de Asia, divide y amalgama las visiones del mundo que más influido. De la misma manera podemos decir qué México es la fusión de la dominante Europa con las antiguas y aisladas culturas precolombinas. Una dualidad que aun no podemos asumir ni entender, al igual que los turcos.

Salvo por el idioma, en Estambul me sentí como si no hubiera salido de México. Veía como mis compañeros españoles veían con estupor la ciudad, comían con precaución la comida... yo me sentía en casa.

Hagia Sophia, la Mezquita Azul, la Cisterna de la Basílica, el Bósforo, tienen una carga emocional que conmociona a quien se detiene a observarlos. Todos las civilizaciones han pasado por ahí y dejado su huella. Entiendo a Flaubert. Esa ciudad es magia, es el reflejo de la humanidad.

La mayoría de los atendimos la Guadec estamos de acuerdo que lo mejor fue el viaje en barco por el Bósforo, bebiendo cerveza, comiendo emparedados de salchicha, el anochecer, las luces de los puentes, el suave vaivén, las conversaciones, la sesión de SMASHED (Single Malt Appreciation Society for Hackers, Engineers and Developers).

Son esos días en la vida en los que te sientes realmente afortunado. ¿Cómo es que he llegado hasta aquí? ... pero falta algo... siempre falta algo...

Awesome Sunset


P1030003.JPG, originally uploaded by markuz.

This was the mondays sunset.

Blast Query Sequence Visualizer Beta


He dado un paso de saltar del track de versión 0.x al track 1.x !!!!

Siguiendo con la interfaz para la representación gráfica de las secuencias, he actualizado muchas cosas, he corregido errores, aclaro hay mas bichos  por eliminar, y he añadido mas funcionalidad respetando como siempre la interacción con el usuario final ya que la interfaz se desarrolla pensando en el usuario final y NO como piensa el desarrollador que es lo mejor para el.

En esta imagen muestro la parte la cuenta del usuario y la opción para editar sus datos, todo corre bajo una “capa asincronica”.

Clutter sample using C


con todo el revuelo sobre Gtk-3, es interesante comentar sobre Clutter!!!

Clutter es una librería que se basa en GObject la cual permite crear interfaces de usuario muy cool. Clutter usa elementos en 2D dentro de un ambiente 3D. estos elementos les llama ‘actors‘ los cuales se pueden escalar, rotar, mover en un ambiente 3D, a su vez puedes modificar propiedades como la opacidad de cada elemento y manipular los eventos que reciben.

para usar Clutter:

  • descargar de http://www.clutter-project.org/sources/clutter/
  • compilar los fuentes en mi caso solo tuve que instalar gtk-doc-utils para generar la documentación de la API. si usas DevHelp te agradara saber que se genera un archivo para devHelp.
    • ./configure –enable-gtk-doc=yes
  • make; make install

cabe señalar que si no especificas el directorio donde se instalara Clutter en configure,  esta predeterminado /usr/local. ahora si no tienes establecidas tus variables de entorno para tus librerías tendrás que hacer el siguiente enlace:

#ln -s /usr/local/lib/libclutter-glx-0.8.so.0.800.0 /usr/lib/libclutter-glx-0.8.so.0

listo ya puedes probar Clutter!!!!!

ejemplo de circulos, para compilar el codigo te puedes ayudar del siguiente makefile

LIBS=`pkg-config –libs clutter-0.8`
INCS=`pkg-config –cflags clutter-0.8`

.c.o:
$(CC) -g -Wall $(CFLAGS) $(INCS) -c $*.c

all: circles

circles: circles.o
$(CC) -g -Wall $(CFLAGS) -o $@ circles.o $(LIBS)

clean:
rm -fr *.o circles
solo cambia a la versión 0.8 ya que la nueva versión especifica LIBS=`pkg-config –libs clutter-0.7` y también INCS=`pkg-config –cflags clutter-0.7` y listo así de fácil. el codigo de los circulos lo puedes descargar de esta liga http://svn.o-hand.com/repos/clutter/trunk/toys/circles/circles.c

en mi ejemplo solo cambie los colores para que se vea mas atractivo!!!!!!

July 16, 2008

16 July, 5:34pm

Last week I attended the Guadec 2008 in Turkey. It was my second Guadec. The first one was in Sevilla in 2002, when I was backpacking Europe. The big difference between my previous and this last guadec is that now I have a better understanding of the state of the art, so I could appreciate more the talks and proposals done, which I will try to summarize in this post.


The Gnome community faces new and not so new challenges. The framework is trying to push its limits to new frontiers besides renovate its own core.

First there is the discussion about the strategy for Gtk+. Imendio is pushing for a ABI breakage in order to polish the API, sealing the private data in the components, among other things. Nevertheless, Miguel, being the voice of several ISV, is disagree with proposed path.

In the Gtk+ road map, a great discussion has been raised about the new canvas. Seems that the favorite contender is Clutter, pushed by OpenedHand.

In other front, Mark Shuttleworth came up with the idea to integrate QT in Gnome, replacing Gtk+ in the long term.

Alp Toker presented the advances in WebKit development, and in my perception, a lot of gnomies are webkit enthusiast, because have a tighter integration with the Gtk+ widgets and better performance than Firefox currently (which is always temporal). So I expect more applications using webkit rather than embedded Mozilla.

Following the web area, there's a big effort, basically from the RedHat guys for the online desktop, integrating the desktop with different and heterogeneous web feeds. I think this is a must for the next desktop environment. More and more applications are web integrated, and give a framework to do this and mix all that information smartly is a huge need.

All the multimedia stack is healthy managed by the guys at Collabora and Fluendo. There's an important effort in data communication (Telepathy and Farsight) using the GStreamer framework. Meanwhile another project, Ekiga, which doesn't use GStreamer is steady and currently the better application for VoIP in Gnome.

Finally, Miguel is pushing for a HTTP desktop applications model, using Moonlight as front end machinery, and a custom HTTP server as gluing proxy for the back end systems applications. A bold idea with not too many supporters.

As colophon we must say in the mobile area are great efforts (Nokia as main bidder) to keep sync with the mainstream development and improve the performance in both fronts.

The ideas are in the table, the discussion is on going, and the code being committed. Where do you want to work in?